万方查重系统作为一种文献查重工具，为了保护用户的隐私，系统会对用户上传的文献进行加密处理，确保文献内容不会被泄露。此外，系统也会严格遵守相关法律法规，不会将用户上传的文献用于其他商业用途。用户可以放心使用万方查重系统进行文献查重，不必担心隐私泄露的问题。

此外，万方查重系统还会定期更新技术，加强系统的安全性和隐私保护能力，以应对不断变化的网络环境和安全威胁。用户在使用万方查重系统时，也可以通过设置权限等方式进一步保护自己的文献隐私。总的来说，万方查重保护隐私措施是为了让用户在使用文献查重服务时感到安心和放心的重要举措。