在论文知网查重过程中，系统主要会检测论文的整体重复率、段落重复率、引用部分的原创性、图片、表格等内容的原创性等。首先，整体重复率是指整篇论文与已有文献的相似度，通常要求低于15%。其次，段落重复率是指论文中各段落之间的重复情况，需要保持较低的重复率。此外，引用部分的原创性也是查重的重要部分，要确保引用内容符合规范，同时注明出处。最后，对于论文中的图片、表格等内容，也需要保证其原创性，避免直接复制粘贴他人作品。

另外，在论文知网查重中，还需要特别注意对于自己的原创性部分进行保护，避免被他人抄袭。可以通过调整语言表达方式、修改句式结构等方法来提高论文的原创性。此外，及时进行论文查重可以帮助发现问题并及时修改，确保论文质量。同时，也可以借助一些查重工具进行自查，提前发现潜在的问题。总的来说，论文知网查重查哪些部分是一个综合性的过程，需要综合考虑论文的各个部分，确保论文的质量和原创性。